锈菌目真菌是目前发现的物种种类最多的一类植物病原菌,对全球农业和林业造成严重危害。锈菌的生活史和基因组结构也是目前真菌研究中最为复杂的。叶锈菌侵染引起的小麦叶锈病是分布最广、发生最普遍的谷类作物锈病。本研究通过PacBio HiFi测序构建了小麦叶锈菌的两套近乎完整的染色体序列,是锈菌目的第一个无缺口基因组组装。通过基因组结构分析和比较基因组学解析发现,转座元件的近期显著扩增和广泛的片段基因复制共同推动锈菌染色体结构的演化;频繁的染色体重排事件可能在锈菌目真菌的物种多样性演化中发挥重要作用。本研究为双核型真菌的高质量定相基因组组装提供了参考,同时为解析锈菌多样性演化的分子机制提供了理论依据。
图示:基于染色体水平的基因组比较分析揭示锈菌间同源基因分布与基因共线性
研究结果以“Gapless Genome assembly of Puccinia triticina Provides Insights into Chromosome Evolution in Pucciniales”为题在国际知名微生物学期刊Microbiology Spectrum在线发表。新葡京集团已毕业博士研究生李闯为论文第一作者,郑文明教授、刘娜副教授和农学院王道文研究员为共同通讯作者,河南农业大学为第一署名单位。本研究得到国家重点研发计划、河南省重大科技专项等项目的资助。
论文链接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02828-22
论文链接:https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02828-22